Werner Freistetter, geboren am 28. Oktober 1953 in Linz an der Donau, ist der Militärbischof für Österreich. Er ist der dritte Militärordinarius des im Anschluss an die Apostolische Konstitution Spirituali militum curae von 1986 eingerichteten Militärordinariats der Republik Österreich.
Freistetter wuchs als Sohn von Divisionär Franz Freistetter, dem längjährigen Chefredakteur der Österreichischen Militärischen Zeitschrift, ÖMZ (1970-1993), unter anderem in Zwölfaxing auf. Er studierte in Wien und Rom Theologie und promovierte in Sozialethik. Seine Priesterweihe erfolgte durch den damaligen Erzbischof von Wien, Franz Kardinal König, am 9. Oktober 1979 in Rom.
In den darauffolgenden Jahren war Freistetter als Seelsorger in Pfarreien der Erzdiözese Wien sowie als Assistent an der Universität Wien am Institut für Ethik und Sozialwissenschaften tätig. Unter Präsident Paul Kardinal Poupard arbeitete Freistetter im Päpstlichen Rat für die Kultur an der Römischen Kurie, bevor ihn Militärbischof Christian Werner 1997 mit der Leitung des in Wien gegründeten Instituts für Religion und Frieden beim Militärbischofsamt betraute. 2006 wurde er durch Militärbischof Werner zusätzlich zum Bischofsvikar für Wissenschaft und Forschung, theologische Grundsatzfragen und internationale Beziehungen ernannt.
2019 wurde Freistetter von Papst Franziskus zum Apostolischen Administrator der von innerkirchlichen Konflikten um Bischof Alois Schwarz zerrissenen Diözese Gurk-Klagenfurt ernannt und direkt dem Heiligen Stuhl unterstellt. Schwarz leitete die Diözese von 2001 bis Mitte 2018 und wurde dann als Bischof von Sankt Pölten eingesetzt.
Am 16. April 2015 wurde Freistetter von Papst Franziskus zum Militärbischof für Österreich ernannt. Die Bischofsweihe erfolgte am 11. Juni 2015 im Dom zu Wiener Neustadt durch den Apostolischen Nuntius in Österreich, Erzbischof Peter Stephan Zurbriggen. Als Mitkonsekratoren fungierten der emeritierte Militärbischof für Österreich, Christian Werner sowie der slowakische Militärbischof, František Rábek.
Daneben wirkte Bischof Freistetter von 28. Juni 2019 bis 2. Februar 2020 als vom Papst ernannter Apostolischer Administrator der von innerkirchlichen Konflikten um Bischof Alois Schwarz zerrissenen Diözese Gurk-Klagenfurtv.
Als Militärseelsorger war Freistetter mehrmals im Auslandseinsatz, darunter auf den Golanhöhen, in Bosnien und Herzegowina, Kosovo und Libanon. Er war langjähriges Mitglied der Ständigen Vertretung des Heiligen Stuhls bei den Internationalen Organisationen in Wien und geistlicher Assistent der internationalen katholischen Soldatenorganisation Apostolat Militaire International.
Freistetter ist als Autor und Herausgeber zahlreicher Publikationen und durch seine umfangreiche nationale sowie internationale Vortragstätigkeit bekannt, unter anderem unterrichtete er an der Naval Postgraduate School der United States Navy in Monterey, CA.